Описание Фруктозо-бисфосфат-альдолазы класса 1 из генома археи Thermoproteus tenax Kra 1.
Описание белка
Основная информация о белке приведена в таблице 1.
| Индетификатор белка | CCC81912 |
|---|---|
| Идентификатор генома | FN869859 |
| Название белка | fructose-bisphosphate aldolase archaeal type class I (FBP aldolase) |
| Координаты гена в геноме | 1118248..1119039 |
| Длина гена (п.н.) | 792 |
| Цепь | обратная |
| Длина белка (а.о.) | 263 |
Данные в таблице были получены так: мы зашли в базу, выбрали тип данных "Protein", сделали поиск по идентификатору белка, перешли по ссылке DBSOURCE, скачали файл с нуклетидной записью. Последовательность белка была найдена в файле с нуклеотидной записью. Параметры файла с последовательностью белка: кодировка файла - ASCII, кодировка концов строк - Unix, последовательность приведена большими латинскими буквами в колонку по 60 символов. Данные о последовательности
Альдолазы класса I(в данном случае фруктозо-бисфосфат-альдолазы) содержатся не только у архей,но и в тканях животных, у высших растений. Фермент играет важную роль в энергетическом обмене,чем может быть полезе архее. В ткани злокачественных опухолей фруктозо-бисфосфат-альдолаза класса 1 в несколько раз активнее, чем в неизмененных тканях.
Геномное окружение белка
Информация о геномной окружении была получена с помощью геномного браузера NCBI в режиме просмотра рамок считывания.
В ходе практикума я научилась самостоятельно искать информацию и разбираться в ней.